1.Flag抗體
Flag標簽是利用基因工程技術使目標蛋白帶上一段特定的氨基酸序列( 即DYKDDDDK)，形成flag標簽與目標蛋白的融合蛋白。由于FLAG標簽尺寸小，且具有親水特性，因此其通常依附于融合蛋白的表面，對融合蛋白的功能、性質影響極小。Flag抗體可以檢測位于蛋白N-末端、C-末端或位于融合蛋白內部的Flag標簽 (DYKDDDDK)，被廣泛應用于研究Flag標簽融合蛋白的檢測和純化、尋找相互作用的蛋白質、探索蛋白質的結構和功能等。
2.His抗體
His標簽是由6個組氨酸 (His-His-His-His-His-His) 組成的短肽，專門設計用于重組蛋白質的吸附純化。由于分子量較小，并且較容易分離和純化，His融合標簽與其他標簽相比有很多明顯優勢，是目前用于純化的融合標簽中使用最為廣泛的一種。利用His標簽可以建立一個基于融合蛋白的高效檢測和純化系統。His抗體可以用于檢測和His標簽融合表達蛋白的表達、細胞內定位，以及純化、定性或定量檢測His融合表達蛋白等。
3.Myc抗體
Myc標簽是一個具有11個氨基酸的短肽 (序列為EQKLISEEDL)，可放在C端或N端，已成功應用于WB雜交技術、免疫沉淀IP和流式細胞術中。Myc的低pH洗脫條件會降低蛋白質的活力，因此常用于檢測，少用于純化。用于檢測重組蛋白在靶細胞中的表達。Myc抗體能與靶蛋白上的Myc標簽相互作用，并特異性地識別Myc標記的靶蛋白。
